Repositório de software

Nosso repositório surgiu da necessidade de instalar o mesmo software em diversas máquinas. A princípio, criamos pacotes para uso interno, mas resolvemos compartilhar publicamente os de licença livre. Confira aqui a lista completa de pacotes disponíveis.

O repositório contém pacotes Debian (.deb), compilados em máquinas com Ubuntu 14.04 (Trusty) e estão sendo usados por nossos grupos de pesquisa. Existem também pacotes para Ubuntu 12.04 (Precise), mas esses não receberão atualizações e serão removidos quando empacotarmos equivalentes para Trusty. Esperamos que funcione em qualquer servidor com SO baseado em Debian, mas não nos responsabilizamos pelo bom funcionamento em qualquer ambiente (vide renúncia de garantia mais abaixo).

Recomendamos os repositórios listados a seguir, para uso conjunto com o nosso. Eventualmente, algum de nossos pacotes podem ter dependências satisfeitas nesses repositórios recomendados. Os pacotes neles contidos são de responsabilidade de seus respectivos fornecedores.

Como adicionar nosso repositório em seu sistema:

$ wget -O- http://pacotes.lbi.iq.usp.br/add-lbi.sh | sudo bash -e

Depois de adicionar o nosso repositório, você poderá instalar os pacotes via apt-get. Por exemplo, para instalar o CheckM:

$ sudo apt-get install checkm-genome

OS PACOTES DESSE REPOSITÓRIO SÃO FORNECIDOS “COMO ESTÃO” NA ESPERANÇA DE QUE SERÃO ÚTEIS. REJEITAMOS QUAISQUER GARANTIAS, IMPLÍCITAS OU EXPLÍCITAS SOBRE O BOM FUNCIONAMENTO DE QUALQUER SOFTWARE NELE DISPONIBILIZADO. EM NENHUMA CIRCUNSTÂNCIA PODEREMOS SER RESPONSABILIZADOS POR QUAISQUER DANOS CAUSADOS COMO CONSEQUÊNCIA DO USO DESSE REPOSITÓRIO, QUALQUER QUE SEJA A FORMA DE USO.