Projetos

NUBIC
O NUBIC (Núcleo de Apoio à Pesquisa em Biologia Computacional e Genômica, antigo NAP-CG) reúne pesquisadores em biociências e pesquisadores em bioinformática para pesquisa e trabalho conjunto em projetos de ciências genômicas. O princípio organizador do núcleo são projetos motores, que são projetos com base genômica, com necessidades sofisticadas de bioinformática, e liderados por participantes do NUBIC.


BIGA
O objetivo deste projeto é realizar avanços no estado da arte em biologia computacional por meio de trabalho interdisciplinar em projetos biológicos. Esses projetos têm em comum entre si necessidades sofisticadas de bioinformática; além disso, vários dos temas importantes da biologia computacional aparecem de forma recorrente em muitos desses projetos, permitindo assim uma sinergia na análise dos dados e no desenvolvimento de novas ferramentas.


Jararaca
Com início no primeiro semestre de 2013, o projeto aprovado pela FAPESP e coordenado pelo Instituto Butantan, consiste no sequenciamento de alta cobertura do genoma da serpente Bothrops jararaca. Atualmente 792 milhões de reads de 100 pb foram obtidos com o equipamento Illumina HiScan da UNESP de Jaboticabal, totalizando 79 Gbp.

MENGOfams
O projeto MENGOfams tem como objetivo criar famílias de proteínas relacionadas a processos de bioenergia em procariotos, baseadas em HMMs (hidden Markov models). As proteínas (reference proteins) utilizadas para gerar os modelos computacionais foram obtidas através de anotações feitas pela equipe do projeto MENGO, que visa a criação de novos termos da Gene Ontology.