Bioinformática é uma das áreas da ciência que mais tem crescido nos últimos anos.
O conjunto de micro-organismos que habitam um determinado nicho se chama microbiota. Microbioma se refere ao conjunto de seus genomas. Microbiomas atualmente vêm recebendo atenção especial por parte da comunidade científica, tendo em vista o número crescente de resultados que mostram sua importância para variados processos associados ao nicho que habitam (ver artigos recentes publicados em Science e Nature propondo iniciativas coordenadas de exploração de microbiomas). Uma das técnicas que tem se popularizado nesse estudo é a de sequenciamento de DNA, mRNA e proteínas dos microbiomas, e que recebe o nome (no caso de DNA) de metagenômica. Essa técnica gera imensas quantidades de dados, tornando essencial o uso da bioinformática para sua análise.
Novas terapias baseadas em estudos da genética, incluindo medicina de precisão (ou personalizada), fazem parte da nova fronteira da ciência médica. O estudo da expressão gênica por meio de transcritomas tem sido importante ferramenta nas pesquisas desta área.
Neste workshop estarão reunidos diversos pesquisadores cujo trabalho depende de bioinformática como área de estudo e/ou ferramenta importante em suas linhas de pesquisa e que também trabalham com microbiomas ou outros conjuntos de dados de grande escala, como transcritomas. As palestras apresentadas representam uma gama variada de pesquisas relacionadas a câncer, angiogênese, esquistossomose, retinopatia, e ciência dos solos, entre outras.
O evento é aberto a qualquer interessado e a inscrição é gratuita.
Quando: 15 e 16 de Dezembro de 2015
Onde: 15/12 no AC Camargo Cancer Center, 16/12 no Instituto de Química da USP
Organizadores:
Diana Noronha Nunes (AC Camargo Cancer Center)
Emmanuel Dias Neto (AC Camargo Cancer Center)
João Carlos Setubal (IQ-USP)
Ricardo Giordano (IQ-USP)
Evento apoiado pelo Núcleo de Biologia Computacional e Genômica da USP e pelo projeto BIGA
Programação
Terça-feira, 15 de Dezembro (palestras em inglês)
Hospital A. C. Camargo, Anfiteatro Senador José Ermírio de Moraes
| 10:30-10:45 | Boas vindas & Apresentação do AC Camargo | Vilma Martins (ACC) |
| 10:45-11:00 | Abertura do evento | João Carlos Setubal (USP) |
| 11:00-11:30 | Microbiomes, health and cancer | Emmanuel Dias-Neto (ACC) |
| 11:30-12:30 | Frontiers in Translational Metagenomics | Ami Bhatt (Stanford University) |
| 12:30-13:30 | Almoço (por conta de cada um; sugestão: Restaurantes Alcachofra & Vienna) | |
| 13:30-16:00 | Brain storming session (15 research projects will be presented – focusing the rationale, experimental approaches and future perspectives). Cada apresentador terá 10 mins incluindo perguntas/respostas. |
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| 16:00-16:45 | Coffee break / Networking | |
| 16:45-18:00 | Technical discussions / Round Table – Discussion involving all steps including DNA extraction, library preparation, bioinformatics analyses, validation, databases. | |
| 18:00-18:30 | Final remarks | |
Quarta-feira, 16 de Dezembro (palestras em português)
Instituto de Química da USP, Anfiteatro Cinza, Bloco 6 superior
| 9:00-9:30 | Recepção aos convidados | |
| 9:30-10:00 | Reconstrução de genomas a partir de dados metagenômicos | João Carlos Setubal (USP) |
| 10:00-10:30 | Estudos de transcritomas bacterianos e metatranscritomas utilizando RNA-seq | Aline Maria da Silva (USP) |
| 10:30-11:00 | Coffee Break | |
| 11:00-11:30 | Comparação de genomas de bactérias baseada em genes: técnicas e desafios | Luciano Digiampietri (USP) |
| 11:30-12:00 | Estratégias computacionais para busca de sinais sobrepostos “sense” a transcritos | Ricardo Vêncio (USP) |
| 12:00-14:00 | Almoço | |
| 14:00-14:30 | Editoração de RNA como um novo mecanismo de inativação gênica por RNAs não codificantes | Emmanuel Dias-Neto (ACC) |
| 14:30-15:00 | Perfil transcricional de vesiculas extracelulares em adenocarcinomas de mama HER2+ | Diana Nunes (ACC) |
| 15:00-15:30 | Análise do transcritoma de tumores pancreáticos utilizando RNA-seq | Eduardo Reis (USP) |
| 15:30-16:00 | Coffee Break | |
| 16:00-16:30 | Transcritômica da retina angiogênica | Ricardo Giordano (USP) |
| 16:30-17:00 | Utilizando dados de NGS para identificar lincRNAs em parasitas | Elton Vasconcelos (Inst. Butantan) |
| 17:00-17:30 | RNA-seq identifica novos genes expressos em ovos e em vermes adultos macho e fêmea de Schistosoma mansoni | Sérgio Verjovski-Almeida (Inst. Butantan) |
| 17:30-18:00 | NUBIC: Perspectivas – Encerramento | João Carlos Setubal (USP) |
| 18:15 | Recepção na praça de integração do IQ-USP | |